U Takashiho Yamazakiho Godzilla mínus jedna “, diváci sa prenesú do Japonska po druhej svetovej vojne, stále spamätávaného z dopadu atómových bômb, ohrozeného novým monštrom schopným zničiť mestá jedným úderom. Hlavným hrdinom príbehu je mladý pilot kamikadze menom Kōichi Shikishima, ktorý sotva prežil vojnu, aby sám pristál uprostred skazy spôsobenej Godzillou. S každým úderom, ktorý sa tento tvor stáva silnejším, je ľuďom v Tokiu jasné, že ho treba raz a navždy zastaviť, aby sa mohli vrátiť k svojim životom a obnoviť krajinu. Ale táto úloha sa ľahšie povie, ako urobí, pretože Godzillina DNA ho robí odolným voči smrti.

Godzilla je obrovská bytosť schopná rozdrviť celé budovy pod nohami, no jeho veľkosť z neho robí aj ľahší cieľ a oveľa jednoduchšie ho zabiť. A vzhľadom na všetky veci, ktoré naňho vrhli, od guliek cez jadrové bomby až po všetky druhy iných príšer, Godzilla by určite zomrela, keby v jeho DNA nebola špeciálna sila, ktorá ho robí zdanlivo neporaziteľným.
Godzilla, podobne ako Wolverine z Marvel Universe, má výnimočnú schopnosť liečiť sa. Bez ohľadu na to, čo sa naňho hodí, bunky tvora sa zregenerujú, rany sa mu zahoja a on sa opäť postaví na nohy. V závislosti od zbrane a závažnosti zranení, ktoré mu boli spôsobené, sa môže doba regenerácie líšiť, ale bez ohľadu na to, o čo ide, Godzilla sa vždy uzdraví a bude ako nová, pripravená roztrhať svojich nepriateľov alebo ich rozdrviť pod nohami.
Práve táto špeciálna kvalita robí bunky Godzilly tak výnimočnými. Nazývajú sa G-bunky a ich regeneračná sila je dostatočne lákavá na to, aby ich vedci dostali do rúk, no je tu ešte jedna vec, ktorá ich robí ešte silnejšími. Pretože Godzilla je rádioaktívna, jeho bunky majú mutačnú silu. To znamená, že môžu viesť k vytvoreniu zmutovaných bytostí, ktoré sú mu veľkosťou a silou bližšie, a to vedci využívajú vo viacerých verziách príbehu. Vo filme „Godzilla Minus One“ je špeciálny dôraz kladený na jeho regeneračné schopnosti, pretože špeciálne vlastnosti G-buniek pripravujú cestu pre budúce možnosti, z ktorých jedna je naznačená v poslednej scéne, keď Shikishima zistí, že Noriko je nažive a zotavuje sa z jej rany spôsobené skazou Godzilly v Tokiu.

Shikishima, ktorá sa niekoľkokrát stretla s Godzillou, vie, že zabiť stvorenie nie je ľahké. Zdá sa, že žiadna smrteľná zbraň na to nemá schopnosť a oni vyskúšali všetko, čo mohli. Godzilla však zničila vojnové lode a zdecimovala mestá jediným úderom. Ako naňho môžu mať dopad jednoduché zbrane a bomby? Shikishima to veľmi dobre vie a tiež vie, že na zabitie Godzilly by potreboval silu Godzilly.
V záverečnom boji je Godzilla zlákaný do mora, kde ho plánuje uväzniť valcami plnými freónu, ktoré by ho dostali na dno oceánu, kde by ho tlak oceánu zabil. Ak by sa tak nestalo, vypustili by bóju, ktorá by tvora vyniesla na povrch takou rýchlosťou, že by ho tlak rozdrvil. Plán takmer funguje, kým sa Godzilla neodtrhne od bóje a freónu a nie je pripravený spustiť svoju horúčavu na lode, aby ich zničil.
Shikishima vedel, že plán zlyhá, ale tiež vedel, že to Godzillu nahnevá natoľko, že ho prinúti použiť vlnu horúčav. Teraz už aj muž vie, že stvoriteľovi trvá niekoľko sekúnd, kým aktivuje energiu a uvoľní ju. Po predvídaní udalostí sa Shikishima pripravil urobiť niečo, čo mohol len on. Bol vycvičený ako pilot kamikadze a keď unikol svojej povinnosti vo vojne, vedel, že tentoraz tým musí prejsť, inak všetkých zabije Godzilla. Po Norikovej smrti na Ginze je motivovaný pomstiť ju a vojakov, ktorých zabilo stvorenie na ostrove Odo.

Ako sa očakávalo, práve keď plán zlyhá a Godzilla sa dostane na povrch, aktivuje tepelný výbuch. Shikishima, ktorý sa vznášal neďaleko, letí k jeho ústam. Jeho lietadlo bolo vybavené výbušninami dostatočne na to, aby zničilo mesto, ale Shikishima vedel, že ani vtedy to nebude stačiť. Musel by načasovať ich výbuch s vlnou horúčav Godzilly tesne predtým, ako sa uvoľní. A tak, len čo uvidí, že chvost šelmy modrou energiou zamieri k nemu a načiahne sa práve včas, aby mu rozbil plán do úst. Keď lietadlo exploduje, cesta pre vlnu horúčav je zablokovaná a namiesto toho, aby zhasla, vybuchne v jeho ústach. Zatiaľ čo výbušniny vyrobené človekom by na Godzillu nemali vplyv, jeho vlastná energia spôsobuje neuveriteľné škody, rozbúri mu hlavu na kúsky a hodí ho do vody.
Vzhľadom na ranu, ktorú dostal, sa zdá, že Godzilla je nadobro hotová, ale posledná scéna filmu sa posúva smerom k kúskom, ktoré bublajú a začínajú sa hojiť. To potvrdzuje, že Godzilla ešte nie je mŕtva. Môže mu to trvať dlhšie, kým sa zahojí, pretože rany boli exponenciálne smrteľnejšie ako tie, ktorým čelil predtým, ale nakoniec bude opäť chodiť po zemi a spôsobí spúšť.